39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1827 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  672    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  54.14 
 
 
277 aa  285  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1303  hypothetical protein  34.88 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  36 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  37.36 
 
 
289 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  42.06 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  36.62 
 
 
319 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  37.18 
 
 
231 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  34.65 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2545  hypothetical protein  39.07 
 
 
217 aa  125  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.102425  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  37.78 
 
 
209 aa  116  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  31.51 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  30.89 
 
 
338 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06870  hypothetical protein  29.3 
 
 
358 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.671903  normal  0.164023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  28.97 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  31.76 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  28.39 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  26.05 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0630  hypothetical protein  24.2 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  24.05 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.39 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.14 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  27.52 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  25.32 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  29.19 
 
 
347 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  36.84 
 
 
148 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  25.32 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  25.32 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  28.16 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  31.48 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  26.39 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  27.64 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  25 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.14 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.36 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.36 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.36 
 
 
284 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>