11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0630 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0630  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  719    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  24.32 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  21.91 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  24.2 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  21.95 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  23.56 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  20.22 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  21.78 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  25.26 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  24.71 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>