21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  729    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06870  hypothetical protein  47.19 
 
 
358 aa  306  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.671903  normal  0.164023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  34.15 
 
 
351 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  30.62 
 
 
289 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  32.89 
 
 
277 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  33.62 
 
 
248 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  31.16 
 
 
231 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  30.16 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  27.08 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  30.81 
 
 
209 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  29.63 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2545  hypothetical protein  30.18 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.102425  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1303  hypothetical protein  27.69 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  26.71 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  27.31 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0630  hypothetical protein  24.71 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>