23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13560 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  738    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  34.15 
 
 
352 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06870  hypothetical protein  36.14 
 
 
358 aa  202  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.671903  normal  0.164023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  27.92 
 
 
277 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  29.39 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  29.3 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  26.64 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  31.37 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  28.52 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2545  hypothetical protein  32.83 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.102425  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  29.25 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  26.9 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  29.29 
 
 
231 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  28.25 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1303  hypothetical protein  23.77 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  28.97 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  27.48 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  27.36 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0630  hypothetical protein  21.95 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  26.47 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  31.82 
 
 
2198 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  29.76 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  25.76 
 
 
2197 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>