19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06870  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  735    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.671903  normal  0.164023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  47.19 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  36.14 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  32.22 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  31.46 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  31.32 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  34.22 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  29.3 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  31.2 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  26.06 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  30.89 
 
 		 209 aa  86.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1303  hypothetical protein  27.08 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  30.37 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2545  hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.102425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  32.89 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  26.6 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.54 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  27.84 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>