112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3541 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  61.89 
 
 
306 aa  355  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  57.73 
 
 
291 aa  296  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  46.91 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  34.86 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  34.28 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  36.91 
 
 
316 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  37 
 
 
313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  34.18 
 
 
302 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  34.38 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03080  hypothetical protein  35.29 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  36.84 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  32.77 
 
 
330 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  36.46 
 
 
310 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  42.57 
 
 
300 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  42.57 
 
 
300 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  42.57 
 
 
300 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  39.46 
 
 
291 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  37.12 
 
 
289 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  38.26 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  34.18 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  34.1 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  34.1 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  33.45 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  32.74 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.34 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  30.18 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32.94 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  36.02 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  30.06 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01230  hypothetical protein  30.5 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  33.79 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  33.79 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  33.79 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  37.4 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  37.4 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  37.4 
 
 
284 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  29.76 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.1 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.1 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  31.09 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2647  hypothetical protein  34.22 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  34.9 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  34.4 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  30.49 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  36.8 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.15 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.15 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  32.52 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  36.45 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  36.45 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  36.45 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  32.8 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  35.92 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  34.65 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  33.19 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  34.97 
 
 
288 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.44 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.86 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  26.67 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  34.44 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  34.44 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  32.08 
 
 
339 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  28.66 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  32.52 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  32.48 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  29 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  29.51 
 
 
320 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  34.96 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  28.3 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4824  hypothetical protein  43.48 
 
 
109 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  29.75 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  32.7 
 
 
289 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  27.61 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.28 
 
 
262 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  34.15 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  26.05 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  30.61 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  30.91 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  27.91 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  31.21 
 
 
261 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  27.16 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  29.19 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  30.83 
 
 
294 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  27.98 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  29.2 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  36.51 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>