184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4768 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  100 
 
 
259 aa  500  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  38.91 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  37.5 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  37.35 
 
 
289 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  37.29 
 
 
357 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  36.99 
 
 
307 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  36.33 
 
 
306 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  33.76 
 
 
320 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  35.62 
 
 
306 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  33.06 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  38.92 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  38.92 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  37.56 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  34.66 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  32.91 
 
 
306 aa  95.9  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.98 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  30.34 
 
 
302 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  34.53 
 
 
374 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  32.63 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  32.94 
 
 
347 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  36.64 
 
 
325 aa  89.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  31.97 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  32.08 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.46 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  33.2 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  30.13 
 
 
313 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  33.66 
 
 
291 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  34.78 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.46 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.46 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  34.94 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  32.67 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  32.67 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  30.8 
 
 
319 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  35.47 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  42.39 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  37.97 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  36.99 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  36.84 
 
 
424 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  36.54 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  37.71 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  35.98 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  31.23 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.5 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  32.57 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  34.57 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  35.41 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  29.22 
 
 
317 aa  82  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  37.18 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  35.54 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  35.54 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  35.54 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  38.41 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  36.96 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  34.67 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  36.96 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  36.26 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  37.04 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  36.4 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.6 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  34.04 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  33.88 
 
 
335 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  28.46 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  33.99 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  30.74 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  36.63 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  33.18 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  36.63 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  36.63 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  35.43 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  35.87 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03080  hypothetical protein  34.42 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  34.66 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  34.27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  34.27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  34.27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.5 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  35.92 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  34.87 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  34.87 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  34.87 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  32.58 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  31.64 
 
 
289 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  31.64 
 
 
289 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  30.23 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  31.4 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  45.37 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  44.95 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  32.92 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  32.34 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  30.2 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  31.36 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  28.51 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  31.62 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  34.66 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>