104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5388 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  99.59 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  97.93 
 
 		 285 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  61.57 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  40.16 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  39.63 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  36.13 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  32.75 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  33.04 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  29.15 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  30.34 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  27.47 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  33 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.82 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.82 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.68 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.39 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  35.92 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  30.34 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  31.33 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  28.31 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.29 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  32.74 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1651  hypothetical protein  33.71 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.173926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  34.94 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.4 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  28.04 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.86 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.82 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.82 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.82 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  29.72 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  27.97 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.28 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  34.13 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  39.66 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  35.94 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  42.31 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  28.19 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  29.27 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  35.92 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  34.57 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.26 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  35.38 
 
 		 316 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  28.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  27.71 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  28.96 
 
 		 424 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.16 
 
 		 1983 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  31.17 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.79 
 
 		 1986 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.83 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  36.84 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  26.2 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 1146 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  27.05 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  37.68 
 
 		 925 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  26.72 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  28.38 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  36.21 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  29.69 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  30.95 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 		 967 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  25.95 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3848  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0110186  normal  0.347936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  27.84 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3954  hypothetical protein  35.09 
 
 		 162 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal  0.657782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  27.83 
 
 		 293 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.83 
 
 		 1959 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  28.92 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  32.91 
 
 		 2045 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  44.64 
 
 		 306 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  36.51 
 
 		 139 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.03 
 
 		 283 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1724 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  27.55 
 
 		 123 aa  42  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01266  hypothetical protein  40.98 
 
 		 117 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  40.98 
 
 		 117 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2336  hypothetical protein  40.98 
 
 		 117 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>