95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5155 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  100 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  36.75 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  37.15 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  36.04 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  36.86 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  36.13 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.83 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.96 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  30.4 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.78 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  34.1 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29.93 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  30.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  29.97 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  28.77 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  28.63 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.73 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  30.9 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22770  hypothetical protein  27.05 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.513597  normal  0.79035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  29.65 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  26.57 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  26.57 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  40.68 
 
 		 148 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  26.57 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.69 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  31.21 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  28.12 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  34.02 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  28.84 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  30.04 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  35.37 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  27.67 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.03 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  27.67 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  29.45 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  27.67 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  28.52 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.43 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  28.52 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  29.6 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  48.39 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4255  hypothetical protein  31.44 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144087  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  29.03 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  26.1 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  37.68 
 
 		 151 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.22 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.52 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.52 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  32.86 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  25.34 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  27.21 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  33.75 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  33.75 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  27.73 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  30.47 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.64 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  27.84 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  28.69 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  28.69 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  34.53 
 
 		 1991 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  29.67 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  38.57 
 
 		 849 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.84 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  29.8 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.29 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  29.09 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  28.72 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  37.84 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  36.14 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  32.5 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  46.03 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  32.59 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1823 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  28.35 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  32.56 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  32.5 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.33 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  29.84 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  25.51 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  43.75 
 
 		 1489 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  35.44 
 
 		 1629 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>