80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0735 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  55.26 
 
 
304 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  42.86 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  35.24 
 
 
325 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  36.22 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  36.74 
 
 
347 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  35.05 
 
 
306 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  35.56 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  33.85 
 
 
318 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  36.4 
 
 
267 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  31.74 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.39 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.67 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  30.29 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.13 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  30.2 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  36.89 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.19 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.19 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  32.33 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  32.5 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  33.59 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  30.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  26.51 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  33.62 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.78 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  29.03 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  29.15 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  29.51 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  33.48 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  32.32 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  31.33 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  27.51 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.96 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  39.81 
 
 
120 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  35.96 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  34.39 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  29.96 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.1 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  35 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  28.1 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  34.74 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  28.14 
 
 
319 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  32.42 
 
 
281 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  28.15 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  27.61 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  27.31 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.24 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  32.02 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  27.15 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  28.51 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.74 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  30.89 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  31.36 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  42.31 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  27.74 
 
 
306 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  27.31 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  29.33 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.34 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  30.98 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  29.67 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  27.49 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.33 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  35.78 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  27.05 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  28.9 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.02 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.02 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  27.23 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.02 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  31.97 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  26.23 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  31.39 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>