108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  34.92 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  33.56 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  33.56 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  36.03 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.9 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  32.19 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  32.66 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  32.48 
 
 		 279 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.99 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.99 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  32.1 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  31.74 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  31.74 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.23 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  29.87 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  29.87 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  30.47 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  31.37 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  30.82 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  30.71 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  30.9 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  32.23 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  31.62 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  30.45 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  28.47 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  32.95 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  29.71 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.75 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.75 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.75 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  27.8 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  39.55 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  27.87 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.34 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  31.41 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.83 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  30.55 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  28.41 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  35.59 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  35 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  26.96 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  32.23 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  24.5 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  38.24 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  30.05 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2647  hypothetical protein  36.28 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  27.68 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  25.76 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  25.76 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  25.76 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  37.25 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  38.38 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  34.04 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  38.61 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  29.57 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  33.61 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  29.91 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.71 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  32.23 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  31.54 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  37.93 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  29.75 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4825  hypothetical protein  30.54 
 
 		 195 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.79 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.79 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  34.17 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  27.48 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  31.67 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  33.94 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  31.78 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  25.34 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  32.82 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  25.86 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  33.68 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.61 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.88 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  25.9 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  35 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  30.3 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  27.39 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>