117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3007 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  832    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  44.76 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  45.45 
 
 		 306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  36.25 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  34.94 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  34.94 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  34.94 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5594  hypothetical protein  34.24 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.738395  normal  0.042079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.6 
 
 		 289 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  37.83 
 
 		 277 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  36.04 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  34.47 
 
 		 295 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  33.6 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.44 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  32.66 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  32.66 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  36.96 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  36.96 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  33.06 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0205  hypothetical protein  43.12 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  32.66 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  42.86 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  32.86 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  32.86 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  33.59 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.93 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.93 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  41.84 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  29.13 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  29.13 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  29.13 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  32.4 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  33.04 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.42 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  32.64 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  32.44 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  31.2 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  36.12 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  30.99 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  32.44 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.54 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.7 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  33.19 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  28.44 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.47 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  36.41 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.52 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.3 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.54 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  31.44 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  30.32 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  31.19 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.16 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  31.17 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  30.47 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  29.15 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.69 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  43.96 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  37.14 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  34.59 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  29.36 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  33.54 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  31.4 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  29.72 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  31.84 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  30.12 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.32 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.32 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  32.85 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  31.44 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  37.19 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  26.8 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  32.29 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  29.63 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  29.63 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  29.63 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  31.39 
 
 		 284 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  31.39 
 
 		 284 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.84 
 
 		 307 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  32.85 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  40.23 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  26.88 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  28.9 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.34 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  28.91 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  29.02 
 
 		 285 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  33.2 
 
 		 316 aa  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  27.95 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.45 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  30.47 
 
 		 337 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  32.77 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  26.23 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>