107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1071 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  55.26 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  40.59 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  35.85 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  33.95 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  37.85 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  33.64 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  33.11 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  31.95 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.72 
 
 		 320 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  35.32 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  34.82 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.92 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.37 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  30.46 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  34.8 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  33.18 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  31.9 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  28.51 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  30.11 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  29.87 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  31.01 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.74 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  28.82 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.86 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  29.91 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  35 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  31.71 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  27.23 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  35 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  27.23 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  35 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  32.63 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  30.39 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.27 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  26.37 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  33.62 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  27.87 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  28.67 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  38.84 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  29.04 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  31.31 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  31.67 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.48 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.19 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  31.74 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1953  hypothetical protein  31.54 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000104092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  27.69 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  27.69 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  35.84 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  31.22 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  42.55 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.94 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  27.69 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  32.82 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  28.42 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  32.47 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  26.28 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  27.03 
 
 		 347 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  29.79 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  30.67 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  26.98 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.95 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  28.79 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  24.89 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  26.7 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  32.58 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  31.97 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  27.56 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  27.56 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  27.56 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  28.82 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  26.99 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  25.79 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  37.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  25.13 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  24.88 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  26.7 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  26.7 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  32.23 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  27.75 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  27.24 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  39.74 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>