50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1580 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  100 
 
 		 305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4255  hypothetical protein  31.94 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  30.63 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  31.37 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.33 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  30.14 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  34.42 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  36.62 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  30.66 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3709  hypothetical protein  29.27 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  33.5 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  52.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  29.77 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1394  hypothetical protein  38.27 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  32.49 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  29.15 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  31.05 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  32.39 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  33.15 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  33.15 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30.69 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30.69 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  31.07 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  29.46 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  42.86 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  27.84 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  28.79 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3561  hypothetical protein  43.08 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  26.28 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2495  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  24.34 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  46.81 
 
 		 2002 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  28.18 
 
 		 1991 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>