124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3354 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  50.5 
 
 
310 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  48.65 
 
 
320 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  38.05 
 
 
262 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  34.56 
 
 
321 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  34.98 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  31.54 
 
 
314 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  33.1 
 
 
307 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  31.86 
 
 
306 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  33.71 
 
 
318 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.73 
 
 
310 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  29.67 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  32.91 
 
 
267 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  29.8 
 
 
347 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  37.11 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.17 
 
 
303 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  30.1 
 
 
329 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.2 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  34.53 
 
 
259 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.38 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  36.02 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  30.2 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  30.77 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  32.22 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  34.26 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  28.8 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  29.67 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  35.06 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  31.52 
 
 
281 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  31.52 
 
 
281 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  35.19 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  29.95 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  29.94 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  29.52 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.91 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  29.81 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  29.81 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  29.59 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  28.32 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  28.32 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.82 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  28.32 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  27.76 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  39.83 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.91 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.72 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.72 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  30.05 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  33.9 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  39.62 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  34.1 
 
 
311 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  30.91 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.21 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.21 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  31.87 
 
 
293 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  27.49 
 
 
348 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  28.92 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  26.64 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  34.07 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  30.42 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  29.31 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  32.12 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  27.47 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  35.77 
 
 
142 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  26.57 
 
 
304 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  30 
 
 
320 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  27.8 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  32.14 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  29.38 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  25.82 
 
 
302 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  32 
 
 
261 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  29.56 
 
 
331 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  28.26 
 
 
289 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.48 
 
 
288 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.38 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.28 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  28.44 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  30.25 
 
 
289 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  30.25 
 
 
289 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  28.4 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.12 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  33.02 
 
 
375 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  27.14 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  27.81 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  38.94 
 
 
352 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  26.64 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.98 
 
 
307 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  28 
 
 
307 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  27.8 
 
 
310 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>