60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5265 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  61.4 
 
 		 285 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  60.35 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  61.57 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  39.16 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  37.59 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  37.15 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  31.71 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  32.62 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  30.88 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.25 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  30.45 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  27.15 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  28.07 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  26.64 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  29.64 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.9 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.06 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2277  hypothetical protein  25.13 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110769  hitchhiker  0.0000150727 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  40.26 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  27.68 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  28.15 
 
 		 424 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  31.5 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  28.72 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  29.33 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  25.43 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  30.3 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  26.55 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  27.24 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  24.91 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  26.06 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  27.4 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  42.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  28.01 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  39.34 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  26 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  23.55 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  27.98 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  26.99 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  27.65 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  37.88 
 
 		 1950 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  37.88 
 
 		 1958 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  29.63 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  25.53 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  31.97 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  24.48 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  24.48 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  24.48 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01962  hypothetical protein  37.74 
 
 		 103 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  24.09 
 
 		 195 aa  42.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  26.09 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  32.81 
 
 		 967 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>