17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1131 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 305 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3561  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  30.88 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  33.85 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23020  hypothetical protein  37.04 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  29.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.51 
 
 		 961 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  37.29 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2301  hypothetical protein  34.09 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  0.158552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 696 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1129  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000041698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  29.41 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  41.82 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  25.54 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>