30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2824 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2824  protein of unknown function DUF559  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0136609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3129  hypothetical protein  58.61 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  47.78 
 
 
272 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  38.52 
 
 
275 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1394  hypothetical protein  30.27 
 
 
295 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3712  hypothetical protein  32.33 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3270  hypothetical protein  29.73 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  32.04 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23020  hypothetical protein  30.65 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.25 
 
 
1403 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27160  hypothetical protein  29.92 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  29.41 
 
 
1421 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1100  hypothetical protein  26.15 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  28.39 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.96 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  38.81 
 
 
137 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0587  hypothetical protein  25.19 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1578  hypothetical protein  32.93 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  38.81 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  39.71 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2952  hypothetical protein  32.93 
 
 
111 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2808  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.446189  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0003  hypothetical protein  37.04 
 
 
123 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  35.71 
 
 
351 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  34.25 
 
 
144 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  35.82 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>