More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3057 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3057  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  998    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  85.91 
 
 		 505 aa  861    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  60.2 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.77 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.49 
 
 		 524 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.08 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 		 527 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.46 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.46 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.46 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.87 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.36 
 
 		 521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.61 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0265  ABC transporter related  42.22 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.44 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 523 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4113  ABC transporter related  40.49 
 
 		 518 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  44 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  40.66 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.92 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.12 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  41.63 
 
 		 501 aa  342  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.72 
 
 		 506 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  39.71 
 
 		 513 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  37.97 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.26 
 
 		 524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.64 
 
 		 505 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 528 aa  339  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.56 
 
 		 507 aa  339  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.93 
 
 		 494 aa  336  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.3 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.67 
 
 		 525 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  38.05 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.12 
 
 		 495 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.78 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.72 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.78 
 
 		 507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.01 
 
 		 500 aa  329  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.21 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.61 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.75 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.75 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38.27 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40 
 
 		 513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  41.32 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  37.35 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  38.35 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  40.86 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.06 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  38.2 
 
 		 504 aa  326  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 505 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.8 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.42 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  39.6 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  39.1 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.65 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.8 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 		 515 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  41.7 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.16 
 
 		 518 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  37 
 
 		 500 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  37 
 
 		 499 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  37.28 
 
 		 513 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  37.18 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  35.32 
 
 		 496 aa  322  8e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.65 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  36.2 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2029  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.08 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 		 515 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  40.12 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  36.51 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.68 
 
 		 512 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.26 
 
 		 519 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 494 aa  319  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  37.43 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  36.2 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.49 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  37.06 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  34.9 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  37.06 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  39.36 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.93 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  38.03 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 504 aa  317  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  36.61 
 
 		 511 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>