More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1630 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1630  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
404 aa  778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663682  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1708  potassium efflux system protein  69.23 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5015  potassium efflux system protein  59.57 
 
 
390 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160977  normal  0.0695428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  55.81 
 
 
602 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.87 
 
 
620 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.61 
 
 
621 aa  325  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.37 
 
 
620 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.86 
 
 
620 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.86 
 
 
620 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  54.74 
 
 
646 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.86 
 
 
620 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.86 
 
 
620 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  54.96 
 
 
632 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  54.2 
 
 
646 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  51.69 
 
 
604 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  49.86 
 
 
627 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.28 
 
 
617 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  47.61 
 
 
605 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  46.01 
 
 
618 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  49.73 
 
 
635 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  41.65 
 
 
624 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.36 
 
 
598 aa  292  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.07 
 
 
600 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.97 
 
 
601 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.97 
 
 
601 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.97 
 
 
601 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  50.26 
 
 
608 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.97 
 
 
601 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.72 
 
 
601 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  42.71 
 
 
601 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  42.71 
 
 
601 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  45.89 
 
 
598 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.61 
 
 
602 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.61 
 
 
602 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  40.29 
 
 
631 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.61 
 
 
602 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.89 
 
 
607 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  44.42 
 
 
601 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.17 
 
 
601 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.17 
 
 
601 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.17 
 
 
601 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.56 
 
 
602 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  44.17 
 
 
601 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.17 
 
 
601 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  50.82 
 
 
616 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.17 
 
 
601 aa  279  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.92 
 
 
601 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.89 
 
 
601 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  43.2 
 
 
624 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.67 
 
 
596 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.22 
 
 
604 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.05 
 
 
602 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  48.26 
 
 
605 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.9 
 
 
610 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.53 
 
 
603 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.53 
 
 
603 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0086  potassium efflux system protein  40.38 
 
 
633 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10218  potassium efflux system protein  40.69 
 
 
629 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2060  potassium efflux system protein  41.62 
 
 
619 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0034449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  39.15 
 
 
628 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  42.16 
 
 
604 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.12 
 
 
608 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.48 
 
 
623 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  39.26 
 
 
628 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  41.16 
 
 
589 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  42.12 
 
 
597 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  41.16 
 
 
589 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  40.15 
 
 
642 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  43.39 
 
 
602 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3545  potassium efflux system protein  45.48 
 
 
655 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  41.16 
 
 
589 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  41.32 
 
 
589 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.9 
 
 
589 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  42.68 
 
 
608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1486  sodium/hydrogen exchanger  37.38 
 
 
622 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.09304  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.14 
 
 
602 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.35 
 
 
605 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  40.97 
 
 
621 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  42.21 
 
 
588 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0111  potassium efflux system protein  40 
 
 
636 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000503548  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0129  potassium efflux system protein  42.21 
 
 
588 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.329444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  41.27 
 
 
604 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  39.32 
 
 
616 aa  249  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  40.68 
 
 
589 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5903  potassium efflux system protein  43.32 
 
 
588 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0112  Kef-type K+ transport  43.45 
 
 
606 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187349  hitchhiker  0.00403769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  41.32 
 
 
589 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  41.32 
 
 
589 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.53 
 
 
613 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.72 
 
 
613 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.55 
 
 
601 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2247  potassium efflux system protein  40.25 
 
 
641 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>