48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1123 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  85.14 
 
 		 148 aa  263  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  47.45 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  38.51 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  38.62 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  38.73 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  39.31 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  33.57 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  32.87 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  30.28 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.2 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.57 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  30.07 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  30.15 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  32.31 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  29.01 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  29.86 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  24.48 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  27.97 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  43.08 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  25 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  28.36 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  24.43 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  24.03 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  26.17 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  25.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  28.17 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  24.64 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  34.09 
 
 		 111 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  26.06 
 
 		 152 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  22.83 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  24.31 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  22.7 
 
 		 146 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>