26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3884 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  74.66 
 
 		 149 aa  220  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  73.97 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  56.16 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  46.21 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  44.83 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  34.72 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  37.41 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  42.22 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  44.74 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  30.83 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  30.88 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  28.68 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  32.17 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  27.66 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  39.39 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  29.32 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  30.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>