44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2719 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  300  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  44.59 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  45.52 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  44.76 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  45.52 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  31.76 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  31.08 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  37.69 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  29.5 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  32.59 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  39.24 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.29 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  30.88 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  30.22 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.03 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  27.54 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  28.67 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  26.76 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  27.1 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  28.68 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  25.87 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  26.81 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  25.53 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  30.15 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  25.17 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  25.87 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  25.37 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  31.82 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  21.43 
 
 		 150 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>