38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0562 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  47.1 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  39.23 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  34.29 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  36.17 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  36.88 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  35.62 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  27.4 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  31.5 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  30.26 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  31.16 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  30.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  30.08 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  29.1 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  32.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  31.69 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  30.5 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  30.85 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  31.63 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  26.06 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  37.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  33.07 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  27.94 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  28.43 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  26.24 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  28.57 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>