19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3609 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  43.66 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  34.81 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.08 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  32.35 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.99 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.99 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30.47 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  26.92 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  29.05 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  25.78 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  26.21 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  24.29 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  24.64 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>