20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1435 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  44.6 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  42.36 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  27.61 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  31.21 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  27.74 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  31.16 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  30.15 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  25.87 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  26.81 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  25.68 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  30.95 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  25.35 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  28.43 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  33.78 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.28 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.28 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  25.35 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>