23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1980 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1980  AtsE  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  42.75 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  46.28 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  36.15 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  37.29 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  34.09 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  29.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  27.35 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  28.92 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  24.64 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  38.16 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  23.48 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  28.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  29.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  29.59 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  25.2 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  30.94 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  23.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  28.15 
 
 		 148 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  36.67 
 
 		 83 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>