41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1667 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  45.95 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  43.06 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  37.76 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  39.69 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  34.97 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  38.62 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  38.62 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  34.97 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  34.69 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  35.11 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  29.05 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  31.3 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  29.45 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  26.53 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  29.45 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  33.64 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  29.58 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  30.14 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  29.82 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  27.14 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  27.82 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  28.68 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.73 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  38.16 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  33.1 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  29.08 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  25.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  24.81 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  26.62 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  25.64 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>