16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02108 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  283  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  29.1 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  30.4 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30.15 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  28.57 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  28.44 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  24.39 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  29.27 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  32.04 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  27.07 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  27.07 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  24.26 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  31.19 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  34.43 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  23.61 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  25.89 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>