47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1670 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  44.14 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  43.94 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  43.18 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  39.16 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  36.36 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  39.23 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  37.88 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  37.69 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  34.85 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  33.83 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  33.59 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  33.08 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  32.31 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.28 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  29.73 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  30.5 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  29.13 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  33.59 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  30.23 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  35.96 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  29.08 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  29.85 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  26.9 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  29.69 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  27.74 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  23.78 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  24.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  25.95 
 
 		 164 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  23.24 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  23.24 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>