40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2573 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  80.54 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  46.53 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  36.36 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  36.89 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  34.48 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.97 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  33.12 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  31.2 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  31.3 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  25.38 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  27.48 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  28.06 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  26.36 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  30.22 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  24.29 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  28.35 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  24.82 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  35.64 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  29.1 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  27.14 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  27.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  24.39 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  26.39 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  23.48 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  25.78 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  25.87 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  23.19 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  33.75 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  24.2 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>