26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3367 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  33.59 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  31.94 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30.83 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  34.09 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  34.48 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  32.5 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  30.4 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  31.3 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.08 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  33.9 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  32.64 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  30.66 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  32.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  29.05 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  31.45 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  26.24 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  26.12 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  27.59 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  25.89 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>