38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1145 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  80.54 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  43.06 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  39.16 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  38.35 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  36.17 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  34.15 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  29.6 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  30.28 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  31.21 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  27.69 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  30.88 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.66 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  27.01 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  27.56 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  28.83 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  26.92 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  28.92 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  27.07 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  28.47 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  25.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  42.62 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  25.35 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  28.24 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  28.47 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  28.47 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  24.11 
 
 		 135 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  29.03 
 
 		 132 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>