25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0764 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0764  AtsE  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  51.49 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  42.75 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  38.52 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  36.3 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  34.56 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  34.56 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  32 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  35.83 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  31.3 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  33.33 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  28.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.29 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  29.5 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  38.1 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  29.93 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  25.87 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  28.17 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  28.24 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.78 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  29.03 
 
 
149 aa  40  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>