40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3988 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  50.68 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  41.22 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  41.22 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  36.49 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  40.41 
 
 		 151 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  34.25 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  33.57 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  31.91 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  32.87 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  31.39 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  32.64 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.59 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  32.14 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  29.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  30.14 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  31.06 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  28.08 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  29.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  29.94 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  29.1 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.13 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  29.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  28.12 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  29.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  30.77 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  31.52 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  30.56 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  26.24 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>