40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1237 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  33.12 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  30.26 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  31.21 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  26.92 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30.43 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  25.3 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  28.76 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  29.73 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  29.49 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  28.3 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  29.94 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  24.84 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.85 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.14 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  26.88 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  39.39 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  29.89 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  34.62 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  29.85 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  23.84 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  30.1 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  26.14 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  25.97 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  31.34 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>