44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2265 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  43.66 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.58 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  36.88 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  31.85 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  31.39 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  30.15 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  31.65 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  26.36 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  27.66 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  33.1 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  35.48 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  28.83 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  28.86 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  26.06 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  27.82 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  27.34 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  31.33 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  25.53 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  32.84 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  32.62 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  26.95 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  31.34 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  31.47 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  32.99 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  23.7 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  28.06 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  29.35 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  26.12 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  25.64 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  25.64 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  38.1 
 
 		 83 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  30.83 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  38.18 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  31.25 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  32.22 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>