21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2873 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  60.56 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  60.56 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  56.16 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  40.41 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  36.3 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  38.81 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  31.58 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  28.37 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  24.32 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  26.43 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  28.24 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>