26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2253 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2253  AtsE  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  51.49 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  46.28 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  33.57 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  33.33 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  30.77 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  30.34 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  31.72 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  34.43 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  25.85 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  33.78 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  29.23 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  30.23 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  29.2 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>