25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03440 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03440  AtsE  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  53.28 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  49.22 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  47.66 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  48.72 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  46.88 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  35.83 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  30.77 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  28.97 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  30.14 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  29.86 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  35.16 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  27.35 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  32.39 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  27.08 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  27.97 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  31.39 
 
 		 155 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  25.78 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  25.42 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>