17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3521 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  100 
 
 
137 aa  264  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  43.54 
 
 
148 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  41.54 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  43.08 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  35.16 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  33.94 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  30.77 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  33.93 
 
 
132 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  29.36 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  31.5 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  30.83 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  26.95 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  31.82 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  33.9 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>