31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3010 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  65.13 
 
 		 152 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  34.48 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  29.55 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  28.67 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  27.27 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  25.95 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  28 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  27.1 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  29.1 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  26.9 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  26.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  27.67 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  26.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  26.06 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  22.52 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  24.82 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  25.97 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  28.28 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  27.69 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  32.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  25.87 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  31.34 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  29.17 
 
 		 167 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  23.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  30.26 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  31.58 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>