17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2693 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  41.61 
 
 
164 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1837  hypothetical protein  42.77 
 
 
164 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1811  hypothetical protein  42.77 
 
 
164 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  36.48 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  27.33 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  28.93 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  30.48 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  27.67 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  33.07 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  26.43 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  25.95 
 
 
148 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  31.52 
 
 
132 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  24.2 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  31.25 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>