253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1558 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  76.07 
 
 		 234 aa  360  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  76.07 
 
 		 234 aa  360  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4086  6-phosphogluconolactonase  50.65 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  49.34 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  48.62 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1269  6-phosphogluconolactonase  36.48 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  44.54 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  44.98 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  44.98 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  44.1 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  44.54 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  44.54 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  45.85 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  39.15 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  40.6 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  42.68 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  41.55 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  38.89 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  38.3 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  40.27 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  37.93 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  35.94 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  39.39 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  39.19 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  41.25 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  37.77 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  38.2 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  38.01 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  38.01 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  38.01 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  37.34 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  38.81 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  46.5 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  45.28 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  43.17 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  37.66 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  36.49 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  39.21 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  37.72 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  35.17 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  34.76 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  41.23 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  36.77 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  38.7 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  39.57 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  36.55 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  36.94 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  37.77 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  38.26 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  39.27 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  35.59 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1894  6-phosphogluconolactonase  34.42 
 
 		 208 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  39.42 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  34.47 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  37.86 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  35.19 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  32.17 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  32.17 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  34.06 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2888  6-phosphogluconolactonase  31.09 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  34.33 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  34.35 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  33.01 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  34.06 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  32.39 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  29.46 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  35.9 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>