261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01245 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  60.87 
 
 
230 aa  291  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  46.67 
 
 
232 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  46.67 
 
 
232 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  46.67 
 
 
232 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  46.67 
 
 
232 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  45.33 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  45.33 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  45.33 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  45.33 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  45.33 
 
 
232 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  46.93 
 
 
231 aa  201  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  45.78 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  44.89 
 
 
232 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  44 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  44 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  43.11 
 
 
232 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  44.89 
 
 
232 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  44 
 
 
233 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  44.44 
 
 
232 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  43.11 
 
 
238 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  45.13 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  44.69 
 
 
243 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  42.24 
 
 
232 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  42.24 
 
 
232 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  41.28 
 
 
237 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  41.28 
 
 
237 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  38.43 
 
 
237 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  38.03 
 
 
238 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  37.12 
 
 
237 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  40.81 
 
 
237 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 
242 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  42.31 
 
 
235 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
234 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
234 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  40.89 
 
 
231 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  39.51 
 
 
238 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  40.71 
 
 
242 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  37.22 
 
 
232 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 
237 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
237 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  39.55 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  38.25 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  33.91 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  36.23 
 
 
242 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  38.6 
 
 
235 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  37.96 
 
 
242 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  37.07 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  38.97 
 
 
226 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  37.22 
 
 
224 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4086  6-phosphogluconolactonase  35.14 
 
 
231 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  37.89 
 
 
223 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
226 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
226 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  38.33 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  36.61 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
226 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  33.63 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  38.19 
 
 
226 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  40.36 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  39.63 
 
 
235 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 
239 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 
239 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1269  6-phosphogluconolactonase  30.22 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  35.95 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2888  6-phosphogluconolactonase  31.51 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  35.93 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.09 
 
 
236 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  35.45 
 
 
245 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.7 
 
 
244 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.61 
 
 
245 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  33.97 
 
 
239 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  32.14 
 
 
238 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  34.43 
 
 
224 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.14 
 
 
238 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.15 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  32.29 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  29.39 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  34.78 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1894  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 
208 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  30.48 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>