235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2078 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  81.47 
 
 		 232 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  78.02 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  78.02 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  78.02 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  78.45 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  77.59 
 
 		 232 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  75.43 
 
 		 232 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  72.84 
 
 		 232 aa  359  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  71.12 
 
 		 232 aa  359  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  71.55 
 
 		 233 aa  357  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  71.79 
 
 		 234 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  48.67 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  46.26 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  44.44 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  44.89 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  44.44 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  44.44 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  43.56 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  41.59 
 
 		 237 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  43.98 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  42.11 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  42.98 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  44.65 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  38.97 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  40.57 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  38.14 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  42.79 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  40.74 
 
 		 237 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  41.59 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  41.74 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  39.66 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  38.7 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  40.19 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  39.46 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  36.68 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  39.27 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  39.27 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1269  6-phosphogluconolactonase  30.94 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  37.12 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  38.97 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  35.27 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 223 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  32.43 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  36.87 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  34.96 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  34.96 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  36.82 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  35.4 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  35.4 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4086  6-phosphogluconolactonase  35.19 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  35.35 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  35.44 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  34.96 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  36.22 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  34.76 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2888  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  32.26 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  34.34 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  32.56 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1894  6-phosphogluconolactonase  32.39 
 
 		 208 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  30.19 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.32 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  29.15 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.09 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  33.51 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>