260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1213 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
225 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  48.04 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  48.04 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  50.25 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  48.9 
 
 
228 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  47.69 
 
 
236 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  47.69 
 
 
236 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  42.47 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  44.81 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  42.44 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  42.16 
 
 
218 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2299  6-phosphogluconolactonase  40.66 
 
 
221 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.020573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  37.92 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  34.93 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
220 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  34.18 
 
 
252 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 
243 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  36.81 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  35.59 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  36.56 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  33.78 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  33.78 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  37.25 
 
 
252 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  34.48 
 
 
245 aa  114  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  35.02 
 
 
241 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  36.76 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  33.78 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  35.75 
 
 
262 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  33.91 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
244 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  35.86 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  36.94 
 
 
261 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  35.07 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 
494 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  30.38 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
429 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  39.43 
 
 
271 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
241 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  34.47 
 
 
249 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31882  predicted protein  31.82 
 
 
276 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
248 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  29.26 
 
 
240 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 
242 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  32.48 
 
 
250 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  33.77 
 
 
240 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
245 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  31.28 
 
 
245 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
245 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  33.79 
 
 
232 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
245 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
241 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  35.16 
 
 
260 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
238 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  32.6 
 
 
249 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  31.37 
 
 
294 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  32.76 
 
 
242 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 
257 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  31.76 
 
 
245 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  32.76 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 
257 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  31.8 
 
 
232 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1157  6-phosphogluconolactonase  32.14 
 
 
232 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  32 
 
 
235 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  31.31 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  31.65 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  30.24 
 
 
238 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  31.19 
 
 
232 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  31.19 
 
 
232 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  31.19 
 
 
232 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  36.29 
 
 
258 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  29.76 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  29.33 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  37.57 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  31.63 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  31.46 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  33 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  30.3 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.4 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  35.15 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  33.91 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  31.63 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  32.2 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  36.96 
 
 
249 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  33.04 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  30.05 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  30.52 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.76 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  29.91 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>