259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0299 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  68.53 
 
 		 232 aa  318  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  66.38 
 
 		 232 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  65.09 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  54.11 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  54.11 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  51.3 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  53.14 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  53.62 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  46.67 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  48.02 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  47.14 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  47.58 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  43.11 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  47.16 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  41.52 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  40.89 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  42.48 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  39.22 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  41.3 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  45.81 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  46.75 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  47.14 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  39.29 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  46.85 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  39.73 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  39.73 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  39.73 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  40.18 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  41.92 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  38.39 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  45.74 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  38.84 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  40.18 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  41.07 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  44.44 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  44.2 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  42.54 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  37.05 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  40.17 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  40.17 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  41.48 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  38.2 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  41.4 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  38.5 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  38.5 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  39.72 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  40.93 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  39.38 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  33.62 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  43.12 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  39.65 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  39.3 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  36.28 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  33.62 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  37.45 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4086  6-phosphogluconolactonase  32.89 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  32.75 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  32.75 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  34.78 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  36.59 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  36.32 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  34.89 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  34.22 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  34.19 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  33.64 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2888  6-phosphogluconolactonase  35.29 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1269  6-phosphogluconolactonase  27.83 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  33.66 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  35.51 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  37.73 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  33.17 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  34.02 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  36.2 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  33.89 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  25.22 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  30.91 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  29.76 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  29.76 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  33.67 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>