225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1683 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  64.13 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  61.43 
 
 		 223 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  61.43 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  59.63 
 
 		 224 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  52.91 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  50.89 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  45.87 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  44.75 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  43.44 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  42.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  37.95 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  41.85 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  38.33 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  35.24 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  44.34 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  42.29 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  38.97 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  36.4 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  36.4 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  40.17 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  36.68 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  36.52 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  36.96 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  36.96 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  35.96 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  38.86 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  37.22 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  37.16 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  37.16 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  37.16 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  36.24 
 
 		 232 aa  121  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  35.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  41.43 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  37.05 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  40 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  37.88 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  37.78 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  34.23 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  33.94 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  37.81 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  36.87 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  36.16 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  37.31 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  31.28 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  37.31 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  31.28 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  33.03 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  39.49 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  32.58 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  34.7 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  33.17 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  37.62 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.79 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  37.14 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  35.14 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  38.76 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  41.98 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.26 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.19 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  35.64 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  37.95 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  30.57 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  39.29 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  32.37 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  35.64 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  33.18 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.69 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  35.56 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  35.76 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  34.16 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  30.29 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  28.36 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  28.36 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  34.09 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  34.09 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  37.44 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  28.44 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  32.18 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  29.78 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>