254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2071 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  85.34 
 
 		 233 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2131  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000254837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2240  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2176  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773853  normal  0.0249488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2253  6-phosphogluconolactonase  78.45 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4526  hypothetical protein  78.45 
 
 		 232 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2047  6-phosphogluconolactonase  76.29 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.229711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2488  6-phosphogluconolactonase  76.72 
 
 		 232 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2045  6-phosphogluconolactonase  76.29 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1930  6-phosphogluconolactonase  76.29 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2150  6-phosphogluconolactonase  76.29 
 
 		 232 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227432  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1867  6-phosphogluconolactonase  77.16 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  76.07 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  74.57 
 
 		 232 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1811  6-phosphogluconolactonase  72.41 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0733242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2078  6-phosphogluconolactonase  71.12 
 
 		 232 aa  359  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  46.02 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  44.4 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3957  6-phosphogluconolactonase  46.22 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  44 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0779  6-phosphogluconolactonase  43.56 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0729  6-phosphogluconolactonase  43.56 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2282  6-phosphogluconolactonase  43.3 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  43.81 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  42.79 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0797  6-phosphogluconolactonase  41.81 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0308207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  41.63 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3142  6-phosphogluconolactonase  43.46 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346082  normal  0.0159337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1833  6-phosphogluconolactonase  40.35 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23080  6-phosphogluconolactonase  39.44 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  40.61 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1023  6-phosphogluconolactonase  36.65 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.725443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1061  6-phosphogluconolactonase  36.65 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  40.38 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1021  6-phosphogluconolactonase  36.61 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1948  6-phosphogluconolactonase  38.97 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1251  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566297  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0460  hypothetical protein  40.27 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0158  6-phosphogluconolactonase  41.06 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15710  6-phosphogluconolactonase  37.93 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0484  hypothetical protein  39.82 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2641  6-phosphogluconolactonase  38.94 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0024  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1301  6-phosphogluconolactonase  39.21 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0299  6-phosphogluconolactonase  38.39 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4201  6-phosphogluconolactonase  37.67 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4866  6-phosphogluconolactonase  35.93 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3789  6-phosphogluconolactonase  35.93 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1551  6-phosphogluconolactonase  40.19 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3054  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.219033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3000  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2131  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3089  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2001  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2613  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.894161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0779  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1683  putative 6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00742345  normal  0.1315 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1269  6-phosphogluconolactonase  34.08 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  38.94 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1951  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433607  normal  0.0210243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1393  6-phosphogluconolactonase  35.65 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2735  6-phosphogluconolactonase  35.65 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3705  6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1777  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.645319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0826  6-phosphogluconolactonase  36.56 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0838  6-phosphogluconolactonase  36.56 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1330  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1026  6-phosphogluconolactonase  35.59 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  0.231316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1529  6-phosphogluconolactonase  34.56 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0626  6-phosphogluconolactonase  38.19 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0372  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1439  6-phosphogluconolactonase  35.44 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0487  6-phosphogluconolactonase  35.81 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0966  6-phosphogluconolactonase  35.81 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0336  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4069  6-phosphogluconolactonase  36.12 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0539  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2432  6-phosphogluconolactonase  36.68 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0927  6-phosphogluconolactonase  35.37 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3453  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125517  normal  0.136512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5328  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5800  6-phosphogluconolactonase  37.85 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4086  6-phosphogluconolactonase  35.02 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2888  6-phosphogluconolactonase  31.62 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1970  6-phosphogluconolactonase  31.88 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00610  6-phosphogluconolactonase  30.53 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.902016  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1894  6-phosphogluconolactonase  33.02 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139742  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.93 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  31.31 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  32.71 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.08 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.53 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  31.37 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  30.29 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  29 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  29 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  29 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  31.38 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>